DNA亲子鉴定与传统的血血型测试有很大的不同。由于血液型号例如A型, B型, O型或AB型, 在人口中比较普遍, 不如DNA亲子鉴定测试有效。往往是血型相同但是不一定就存在亲子关系。而DNA亲子鉴定则不同, 每个人的DNA就好像指纹一样独一无二，不会存在误差。
DNA是从几滴血，腮细胞或培养的组织纤内提取而来，用畴素将DNA样本切成小段,放进喱胶内，用电泳槽推动DNA小块使之分离，最细的在最远,最大的最近。之后,分离开的基因放在尼龙薄膜上，使用特别的DNA探针去寻找基因,相同的基因会凝聚于一，然后利用特别的染料,在X光的环境下,便显示由DNA探针凝聚于一的黑色条码。
小孩这种肉眼可见的条码很特别，一半与母亲的吻合，一半与父亲的吻合。这过程重覆几次。一种探针用于寻找DNA的不同部分并影成独特的条码, 用几组不同的探针, 可得到超过99.9999999%的父系或然率或分辨率。
DNA亲子鉴定是最为有效的方法，也是目前亲子测试中最准确的一种。即使在母亲不在的情形下依然有效。如母亲不参与测试, 小孩和测试男子的DNA模式在一个或多个的DNA探针上不吻合, 那被测试男子便被100%排除, 即他是0%可能是亲生父亲，他不可能是孩子的生父。如果孩子和被测试父亲的DNA模式完全吻合, 那我们可以计算出99.9999999%支持被测试男子是孩子的生物学父亲。
